Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CASKO14936 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASKO14936 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASKO14936 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms