Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELL2O00472 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ELL2O00472 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELL2O00472 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELL2O00472 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms