Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3C2AO00443 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3C2AO00443 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms