Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms