Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms