Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms