Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNQ9UQP3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNQ9UQP3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms