Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNX7Q9UNH6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNX7Q9UNH6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms