Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPCN1Q9ULQ1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPCN1Q9ULQ1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms