Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF346Q9UL40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms