Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIKQ9UKE5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms