Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DCTN4Q9UJW0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCTN4Q9UJW0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms