Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRM2Q9UI43 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms