Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPN3Q9UHW5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms