Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDRG3Q9UGV2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDRG3Q9UGV2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms