Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNAL1Q9UBT7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms