Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
XCL2Q9UBD3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XCL2Q9UBD3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms