Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL9Q9P2J3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms