Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIPA1L2Q9P2F8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIPA1L2Q9P2F8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms