Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RRBP1Q9P2E9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms