Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS1Q9NYS0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms