Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms