Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PNPLA3Q9NST1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms