Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VPS45Q9NRW7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms