Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP29Q9HBJ7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms