Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms