Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF17Q9BXT8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF17Q9BXT8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms