Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SRRTQ9BXP5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SRRTQ9BXP5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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