Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFT27Q9BW83 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFT27Q9BW83 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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