Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms