Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HIRIP3Q9BW71 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms