Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP58Q9BVL2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms