Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAGR1Q9BTK6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms