Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TIMM29Q9BSF4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms