Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MESP1Q9BRJ9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms