Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BPIFA3Q9BQP9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BPIFA3Q9BQP9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms