Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBA1CQ9BQE3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms