Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CICQ96RK0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms