Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF12Q96QT6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms