Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC43Q96MW1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms