Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VCPIP1Q96JH7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms