Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COG3Q96JB2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COG3Q96JB2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms