Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCC12Q96J65 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCC12Q96J65 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms