Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHDQ96IW2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms