Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNFT2Q96EX2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms