Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM3DQ96BQ1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM3DQ96BQ1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms