Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAVIN3Q969G5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms