Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms