Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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GTF3C6Q969F1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF3C6Q969F1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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