Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRUQ92729 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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